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Das ist das automatische Verhalten von RadioButtons. In einer Gruppe kannst Du einen RadioButton nur deaktivieren, wenn Du einen Anderen aktivierst. Wenn Du einen aktivierten RadioButton deaktivieren willst, indem Du draufklickst, mußt Du das selber programmieren.
Du legst für jede Checkbox einen Ereignishandler an für die BN_CLICKED-Nachricht. Darin überprüfst Du den aktuellen Status der Checkbox und veränderst ihn dementsprechend.
Die Checkboxen dürfen natürlich nicht in einer Gruppe sein und die Auto-Eigenschaft nicht gesetzt.