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Ich verstehe die Frage nicht. Das "obj" Dateiformat ist z.B. XML und wird von three.js unterstützt. three hat außerdem sein eigenes Format (du verwendest ja bereits das Blender Plugin). Die beste Performance bekommst du zweifellos mit dem JSON format (https://github.com/mrdoob/three.js/wiki/JSON-Model-format-3.0) ganz einfach weil das initiale Parsen der Modelle weg fällt.