Wenn du den Baum änderst musst du die XML-Datei natürlich auch ändern. Aber du musst ja auch die Datenbank ändern wenn du den Baum änderst. Du kannst unter jeden Knoten beliebig viele weitere Knoten anhängen, ebenso wie du in die Datenbank beliebigviele Nachfolger definieren kannst. Damit kannst du den XML-Baum direkt an die Struktur deines JTree-Baums anpassen.
Ich verstehe nicht wo dein Problem damit ist.
Ich verstehe nicht wo dein Problem damit ist.