Ich würde fast vermuten der Lösungsansatz von SonMiko, das ganze als Flv aus Aftereffects zu exportieren und in Flash einzubauen bringt wohl die besten Qualitäts Ergebnisse. Ich glaube Swf aus After Effects macht nur Sinn für Vectoranimationen, d.h. Masken, etc. Allerdings ist das Hauptproblem, das man per Actionscript nicht auf die exportierten swf zugreifen kann. Zumindest nicht auf die Frames, also im Sinne von; 'play thisFrame', oder 'if Frame == last Frame, play again'.
Als Video hättest du auch den Vorteil, Preloader zu benutzen, damit dein User nicht erstmal vor dem blanken Bildschirm sitzt usw.
Mhm, befürchte fast richtig viel Hilfe, war das jetzt auch nicht.