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Ich gehe mal davon aus, dass die Datei über einen Link heruntergeladen wird.
Du könntest zb. beim Klick auf den Link eine Aktion ausführen, welche dir eine Datei auf dem Server legt und du somit weisst, die Datei wurde runtergeladen.
Das kannst du dann ganz einfach abfragen, bevor du den Link schreiben lässt.
Das sicherste ist die Log-Dateien auszuwerten. Denn anhand der dortigen Informationen lässt sich auch feststellen, ob eine Datei vollständig oder nur teilweise heruntergeladen wurde.
Mit PHP lässt sich zwar ähnliches realisieren (siehe Download slots ermöglichen nur wie?), doch das scheint etwas an den Ressourcen zu nagen.