Hallo,
also ich wüsste keinen Grund warum man das nicht tun können sollte.
Die Plugins in den Entwicklungsumgebungen haben ja nichts mit dem Server zu tun und welche Dateien sich auf dem Server befinden, ist dem Server eigentlich egal.
Ich nutze zwar Subversion nur für Java-Projekte, aber in diesen Projekten gibt es auch Properties-, XML-, HTML- und Javascript-Dateien und es gibt keine Probleme.
Gruß
Sascha