Da gibt es jede Menge möglichkeiten, ein PHP Frontend, z.B. PHPMyAdmin oder ein Client Front End wie eben MySQL-front oder Control Center. Oder direkt über die Konsole entweder am Server selber oder über Remote Shell.
Ich denke mal du kannst nicht connecten weil eteas mit den Berechtigungen nict stimmt, denn der Root darf standardmäßig nur vom Localhost aus connecten, das ist ein ser beliebter Fehler.
Greetz...
Sinac