Im Grunde wird das sicherlich gehen, aber du mußt monodevelop unter Knoppix erst mal kompilieren und dazu mußt du unter Knoppix erstmal mono (+ gtksharp, gecko-sharp, gtksourceview-sharp, etc), dann noch gtksourceview und mozembed (inklusive der Header) installiert haben.
Ich weiss nicht was alles bei Knoppix dabei ist, ich gehe aber davon aus das die meisten Sachen erstmal gar nicht vorhanden sind.