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Alle Ebenen auswählen die sich innerhalb einer Selektion befinden
Fragen wir mal anders: Was ist der Zweck des ganzen? Willst du etwas welches sich sichtbar in einer Auswahl befindet ausschneiden aber es wird immer nur das geschnitten welches sich auf der aktiven Ebene befindet?
Dann würde ich vorher alle Ebenen markieren und mit dem Shortcut Strg+Alt+E eine Kopie der Ebenen erstellen. Die Originalebenen bleiben erhalten und du kannst auf der Kopie schneiden.